A múltban S. Donato a Poggio városközpontja a zóna egyik fő erődített települése volt. Érdemes megemlíteni a castrumot 1033-ból, a várat a Val di Pesa és a Val d'Elsa völgyeit elválasztó dombok felett magasra építették. A helynév a 989-ben bejegyzett templom címéből származik S.Donato néven Loco Pocie-ban. Pocie, majd Poce vagy Poci volt a lakott település neve, melynek fele a VI. Enrico VI. Guidi gróf fejedelme 1901-ben.

A XII. Században a S. Donato a Poggio-kastélyban bizonyos mértékű autonómiát élvez és szabad tanácsgá vált. 1218-ban a kastély véglegesen alárendelték a firenzei köztársaságot, így jelentős stratégiai jelentőséggel bírtak a Strada Romana legközvetlenebb útján, amely a firenzei Sienával összekötte. A firenzeiek és a sziennesek békeszerződést kötöttek Szent Donáton 1255-ben, és a firenzei hadsereg gyülekeztek ebben a kastélyban, mielőtt a Montaperti harc előtt harcoltak a sziennaiak ellen.

Az aréniai Ghibellinek 1289-ben elpusztították a középkori települést. A település erődítményeinek egyetlen maradványa talán a mai önkormányzati harangtorony alsó része. Az újjáépítés az invázió után azonnal megkezdődött, és a firenzei Köztársaság és a Bernardo Gherardini plébános finanszírozta. Egy magas fal tartotta a kastélyt. A fő falon lévő belső fal nélküli torony és séta alkotta a két kaput a kastélyhoz, egyiket Firenze felé nézték, a másik pedig Siena felé nézett. A lakott területen belül az õsi õrzõk vagy a sólymok befejezték a védelmi struktúrát. Hosszú idő elteltével azonban a kereskedelem fejlődése és a falakkal körülvett várterületen belül további megfelelő építési terület hiánya szükségessé tette az új település kialakítását a szieneni kapun kívül, a Strada Romana mentén. A Firenzét körülvevő országos közigazgatási átszervezés következtében S. Donato-t nevezték ki egy olyan liga vezetőjének, amely három plébánia joghatósága volt: S. Donato, S. Pietro in Bossolo és S. Appiano. A Florentin Köztársaságból származó Podestà kormányozta ezt az új közigazgatási szervezetet.

A város téren, a Piazza Malaspina néven ismert magisztrátust XV. Századi freskóval díszítették, amely még megtekinthető. Az épületet nagyrészt az utolsó háborúban elszenvedett károkat követően rekonstruálták. A tér másik oldalán az 1867-ben újjáépített nyilvános tartály és a XIV. Századból származó várkastély volt. A Ticci-palota késő reneszánsz homlokzata (amely később áthaladt a Malaspina családra) egyesült a házak és üzletek a tér északi és nyugati részén. A kastélyon ​​kívül lévő faluban az augusztusi szerzetesek által vezetett szegényekre kórház volt, majd a Szent Mária a Neve testvéri közösség vezette. A XV. Század elején a falu hanyatlása jelent meg. Ez annak köszönhető, hogy a Strada Romana újabb útvonala, amely Sambuca-tól Morroccoig vezetett, és Tavarnelle és Barberino útján haladt el, hogy elérje a Val d'Elsa-völgy nagy központjait.